Gli archivi delle singole comunità religiose provenienti dai tre Dipartimenti in cui era stata suddivisa fin dal 1801 la Toscana - Arno, Ombrone e Mediterraneo - furono così concentrati presso le Prefetture, mentre la documentazione amministrativa più recente restava presso i ricevitori periferici dell'Amministrazione del Registro e Demanio. Dalle singole Prefetture le scritture, che necessitavano di una sistemazione più adeguata, furono poi trasferite a Firenze.
Iniziò così a costituirsi un grande archivio, definito "Archivio del Demanio", collocato agli Uffizi; per il riordino delle carte e la stesura di inventari fu incaricato, il 17 giugno 1808, l'abate Reginaldo Tanzini, che assunse la carica di Commissario speciale. Il successivo decreto del settembre del 1810, con cui venivano soppressi tutti i conventi, ad eccezione di pochissime comunità religiose, incrementò il patrimonio dell'archivio; una parte della documentazione - le pergamene - fu poi estrapolata e destinata al fondo Diplomatico. Negli anni seguenti i beni incamerati furono ceduti ai possessori di luoghi di Monte, col deliberato intento di sanare il debito pubblico toscano.
Nel maggio 1814, ristabilito il governo lorenese, fu istituita l'Amministrazione dei beni ecclesiastici al fine di amministrare i beni residui, che avrebbero dovuto tornare poi alle comunità religiose ripristinate; a questa Amministrazione fu sottoposto l'archivio, definito ora "Archivio dei beni ecclesiastici", la cui direzione fu assegnata a Tanzini.
La necessità, dopo il Concordato con la Santa Sede del 1815, di accedere in modo più immediato alla documentazione dei conventi che sarebbero stati ricostituiti, spinse a istituire un unico grande archivio in cui fossero conservate anche le carte provenienti dalle comunità religiose soppresse del Mediterraneo e dell'Ombrone; il 26 febbraio 1817 fu quindi istituito l'Archivio centrale delle corporazioni religiose soppresse, ed il Tanzini ne fu nominato sovrintendente. Nella stessa occasione fu deciso, su proposta del Tanzini, di procedere ad operazioni di scarto di una parte della documentazione; i criteri adottati intendevano salvaguardare la documentazione di natura amministrativa, ritenuta di interesse primario. Lo scarto proposto dal Tanzini fu tuttavia effettuato diversi anni più tardi, nel 1839 e nel 1842.
Con la nascita dell'Archivio di Stato di Firenze, nel 1852, la documentazione delle Corporazioni religiose soppresse dal governo francese fu versata nel nuovo Archivio di Stato; in quell’occasione l’archivista responsabile, Telemaco del Badia, provvide a compilare degli inventari sommari con rispettiva numerazione di filze e registri per quei fondi che ne risultassero mancanti: il risultato del suo lavoro, effettuato sulla base delle descrizioni apportate da Reginaldo Tanzini, sono i volumi di inventari e indici tutt’ora in uso.
Con l'istituzione degli Archivi di Stato di Siena e Pisa nel 1858 e nel 1860, infine, le carte delle comunità religiose soppresse dei Dipartimenti dell'Ombrone e del Mediterraneo furono trasferite nei rispettivi Archivi di Stato.

Acquisito da: Archivio centrale delle corporazioni religiose soppresse